Nhân vật chính là cậu thiếu niên Jake (Asa Butterfield) sau khi ông nội qua đời, cậu tìm đến mái ấm kỳ lạ của cô hiệu trưởng Peregrine (Eva Green) ở một vùng hẻo lánh nước Anh, nơi tưởng như chỉ tồn tại trong những câu chuyện cổ tích. Jake làm quen với nhiều người bạn mới sở hữu năng lực dị biệt, đồng thời phát hiện ra mình là nhân tố quan trọng trong cuộc chiến chống lại bọn sinh vật Hồn Rỗng.