Phim xoay quanh cuộc chiến của Ultraman với loài sinh vật khổng lồ được gọi là “S-Class”. Sau khi loài sinh vật xuất hiện, chính phủ Nhật Bản đã thiết lập nghị định trấn áp các loài S-Class để loại bỏ các mối đe dọa này. Ngay sau đó, SSSP giải quyết cuộc tấn công của quái vật Neronga. Đúng lúc này thì một “Ultraman" xuất hiện và đánh bại con quái vật để cứu nhân loại. Tuy nhiên, anh ta đã vô tình giết một thành viên của SSSP là Shinji Kaminaga, sau đó biển thành Shinji và để lại cơ thể thật của Shinji trong một khu rừng. Ultraman trong hình dạng Shinji sau đó đã kết bạn với nhà phân tích Hiroko Asami của SSSP, mở ra hành trình đầy thú vị.